杨叔禹先后毕业于辽宁中医学院中医班(五年制)、中国中医研究院研究班、厦门大学管理学院和福建中医药大学。1983年起在营口中医院内科任住院医师、主治医师、副主任医师,1993年任营口市中医院副院长,1996年晋升主任医师。1996年10月月后调往厦门工作。曾先后担任厦门国际中医培训交流中心主任医师、厦门市第一门诊部主任、厦门市中医院院长、厦门市卫生局副局长。2005年7月至2012年9月担任厦门大学附属第一医院院长,现任厦门市卫生局局长,厦门市科协副主席、厦门大学医学院副院长,厦门市糖尿病研究所所长。兼任中华中医药学会糖尿病分会副主任委员,中华医学会糖尿病学分会委员,福建省中医药学会糖尿病分会主任委员,厦门市医学会糖尿病学分会主任委员等职务。曾获“中国医院优秀院长”、“中国医师奖”。
从事中医、中西医结合的临床、科研和教学工作30余年。长期从事糖尿病及糖尿病慢性并发症如糖尿病肾病、眼底病、周围神经性病变的诊治,肿瘤病人术后及放疗、化疗后的中医治疗,亚健康如睡眠障碍、便秘、自汗、盗汗等的中医中药调理等。
在医疗上提出“糖尿病经纬辨证”学说;针对糖尿病的不同病理阶段研制出“平糖浓缩胶囊”系列方药用于临床;先后参加过全国《糖尿病中医防治指南》和2010版《中国2型糖尿病防治指南》的编写工作。指导博士后研究人员12名,培养博士和硕士研究生30余人;主持包括国家自然科学基金、国家科技支撑计划及省市级科研课题20余项;发表SCI源及中文核心期刊论文50余篇,并主编《糖尿病中西医研究进展》、《糖尿病中医选议精剂》等多部专著。科研成果先后有四项获得省部级奖项,三项获得市级科技进步奖。2012年获厦门市科学技术重大贡献奖。