黄明东目前为福州大学化学学院教授、哈佛大学医学院BIDMC医院兼职讲师。研究方向包括:(1)光动力学抗菌和抗肿瘤研究。发展了一种潜在抗菌药物,主要特点是广谱性:可以杀灭包括革兰氏阳性和阴性的多种细菌,特别是能够杀灭耐药菌。(2)血栓和纤溶系统中的重要蛋白质的三维结构及其构效关系研究,发展系列的抑制剂。他发表原创科研文章140多篇,有五篇发表在《科学》和《自然》及子刊杂志上,其中三篇为第一或通讯作者。组建了中国丹麦第一个双边研究中心(http://www.proteasesandcancer.org)。组织了多次国际会议,包括了2009年和2012年的中丹肿瘤和水解酶国际会议,以及2013年诺和诺德-中科院国际研讨会。2006年获得国家基金委杰出青年科学基金。